این فدراسیون دارای هیات اجرایی و متشکل از کمیته‌هایی است که در حوزه‌های تنوع زیستی، آموزش، ارزیابی خطر کلکسیونها، ثبت اختراع، مقررات پستی، قرنطینه و ایمنی فعالیت می‌کند.
این فدراسیون همچنین دارای یک پایگاه داده بین‌المللی موسوم به مرکز اطلاعات جهانی میکروارگانیسم‌ها یا WDCM است که اطلاعات نزدیک به 476 کلکسیون میکروبی از 62 کشور جهان؛ از قبیل داده‌های سازمانی، مدیریتی، خدماتی و توانایی‌های علمی کلکسیونها را در خود ثبت کرده است.
این پایگاه اطلاعاتی که هم اکنون در انستیتو ملی ژنتیک ژاپن نگهداری می‌شود، منبع اطلاعاتی مهمی را برای تمامی فعالیت‌های میکروبیولوژیک فراهم آورده است و همچنین به عنوان یک هسته متمرکز برای فعالیت‌های اطلاعاتی میان اعضای WFCC عمل می‌کند.
بر اساس آمار منتشر شده در سایت رسمی این مرکز، مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران با نگهداری 220 سویه آرکیایی که عمده آنها از جدایه‌های بومی ایران هستند جزء 4 کشور نخست جهان است که بیشترین تعداد آرکی را نگهداری کرده است.
بر اساس این رتبه بندی ایران پس از کشورهای اسپانیا، آلمان و ژاپن در مقام چهارم جهان و دوم آسیا قرار دارد.
در حالی که آرکی‌ها حلقه مفقوده و رابط بین پروکاریوت‌های قدیمی و یوکاریوت‌ها هستند، این موجودات معمولا در شرایط سخت مانند دمای بالا، غلظت اسیدی شدید یا غلظت زیاد نمک زندگی می‌کنند که این شرایط، آرکی‌ها را به میکروارگانیسم‌های توانمند و دارای کاربردهای بیوتکنولوژیک و صنعتی تبدیل کرده است.
تاکنون سه جنس و یک گونه جدید بومی آرکی با نام‌هایHaloarchaeobius iranensis, Halovenus aranensis Halopenitus persicus, Halopenitus malekzadehii در مرکز ملی ذخایر ژنتیکی شناسایی، و در مجامع بین المللی ثبت و معرفی شده است.