سردار جلالی رئیس سازمان پدافند غیر عامل کشور، در پیامی فوت مرحوم آیت‌الله شیخ محمد آل اسحاق را به دکتر یحیی آل اسحاق تسلیت گفت،متن پیام به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
انالله و اناالیه راجعون
درگذشت عالم پرهیزگار حضرت آیت‌الله شیخ محمد آل اسحاق،رحمة الله علیه از شاگردان مبارز و انقلابی حضرت امام خمینی(ره) را که سالیان متمادی همچون سربازی وفادار به انقلاب و نظام اسلامی، شجاعانه و فعالانه در عرصه های مبارزه با رژیم ستمشاهی ، افشاء جنایات رژیم طاغوت و ایجاد حرکت‌های انقلابی در مردم پرداخته و همزمان به تربیت دینی و شور انقلابی جوانان همت می‌گمارد آنچنان که زندان‌های رژیم منحوس پهلوی هنوز فریاد «یا الله» این مبارز خستگی‌ناپذیر را زیر شکنجه های «کمالی» شکنجه‌گر معروف به یاد دارد به طوری که آثار شکنجه تا پایان عمر همچنان در بدن وی باقی بود،موجب تأثر و تألم فراوان گرديد
بزرگترين امتياز این شخصیت والامقام در طول حيات طيبه خودترویج طب اسلامی و تربیت صدها شاگرد در این زمینه و معالجه و درمان هزاران بیمار صعب العلاج از سراسر کشوربود که نام ایشان را جاودان کرده است.
نقش ارزنده و حضور فعال شهید مهندس ابوالحسن آل اسحاق در دانشگاه تبریز و پس از پیروزی انقلاب اسلامی در دفاع از انقلاب و مقابله با جریاناتی چون غائله خلق مسلمان و حضور در جبهه به عنوان نیروی بسیجی همراه و همرزم شهید مهدی باکری ، ریشه در تربیت و پرورش این پدر آگاه و معتقد به آموزه‌های مکتب حق‌طلب اسلام دارد.
این مصیبت را به جنابعالی و خانواده محترم آن فقید سعید تسلیت می‌گویم و از درگاه خدای رحمان برای آن مرحوم رحمت واسعه الهی و همجواری با روح بلند فرزندان شهیدش و برای سایر بازماندگان صبر جمیل و اجر جزیل مسئلت دارم.
رئیس سازمان پدافند غیر عامل کشور
سردار سرتیپ پاسدار غلامرضا جلالی